Mentionné dès 869, Prunet est seigneurie directe des Castellnou, vicomtes du Vallespir qui rendent hommage au roi Sanche. Après la suppression du titre de vicomte (1321), Prunet fut incorporé à la baronnie de Castellnou. A la veille de la Révolution française, c'est le marquis de Llupia qui était seigneur de Prunet et Belpuig.

L'église Saint-Etienne est une église préromane à nef unique, orientée à l'Est avec un chœur plus étroit et plus bas que la nef et de plan trapézoïdal. Un clocher quadrangulaire se dresse au-dessus de la partie orientale de la nef. Sur le côté Sud s'est greffée, tardivement, une chapelle latérale tandis qu'une sacristie a été aménagée contre l'élévation Sud du chevet. Le chœur est couvert d'une voûte en berceau qui s'ouvre sur la nef par un arc triomphal diaphragme. La voûte de la nef est en berceau légèrement outrepassé, elle prend appui sur des arcs formerets en plein cintre, percés au Sud, pour permettre la communication avec la nouvelle chapelle. La porte d'entrée, sur la façade occidentale est en marbre rose (13e siècle). Le gros œuvre est fait de blocs moyens simplement dégrossis et noyés dans le mortier. Les chaînages d'angle sont constitués de lauses allongées et disposées en harpe. A la base de l'angle sud-ouest, un bloc rectangulaire muni d'une encoche profonde, au centre, correspond à un réemploi provenant d'un édifice antique. Le clocher est éclairé par des baies géminées à colonne en tuf assez rustique portant un chapiteau tronconique. Il s'agit là d'un des tous premiers modèles de clocher appelés à évoluer plus tard avec les tours-clochers lombardes. Il en existe d'autres exemples, entre autres à Santa Creu de Rodes et à Sant Mateu de Bages. Dans l'état actuel des connaissances on peut considérer que l'église Saint- Etienne était voûtée dès l'origine tant sur la nef que sur le chœur ce qui n'est pas exceptionnel sur les terres du Nord-Est catalan.